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表型信息學(xué)分析
日期:2016-11-16 14:02:00

植物結(jié)構(gòu)特征性很強(qiáng),具有復(fù)雜的三維結(jié)構(gòu)。對(duì)自然界的植物形態(tài)及生長(zhǎng)發(fā)育進(jìn)行建模,有利于探索植物生長(zhǎng)過(guò)程的規(guī)律,同時(shí)還能在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中指導(dǎo)作物栽培、新品種選育及模擬農(nóng)作物管理。AgriPhenoTM 平臺(tái)培養(yǎng)室內(nèi)植物,對(duì)其進(jìn)行3D 掃描成像,可構(gòu)建三維點(diǎn)陣云圖,還可以通過(guò)可見(jiàn)光結(jié)合計(jì)算機(jī)視覺(jué),可進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化非破壞性的高通量分析。

作物穗結(jié)構(gòu)與種子性狀屬于多基因位點(diǎn)控制的數(shù)量性狀,可間接反映產(chǎn)量潛力、種子的活力和質(zhì)量,研究穗結(jié)構(gòu)與種子性狀,對(duì)于育種、種質(zhì)資源研究具有深遠(yuǎn)意義。常規(guī)的穗結(jié)構(gòu)與種子性狀分析多采用人眼觀(guān)察、尺子測(cè)量的方法,誤差大,可實(shí)現(xiàn)的參數(shù)少,可重復(fù)性差。AgriPhenoTM 平臺(tái)標(biāo)準(zhǔn)化無(wú)損的高通量測(cè)量穗結(jié)構(gòu)以及種子,大大提高了測(cè)量精度以及效率。

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掃描得到的3D點(diǎn)陣云圖

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基于Scanalyzer HTS頂部可見(jiàn)光成像的包菜種子形態(tài)、大小篩選

除了數(shù)量性狀的建模分析,AgriPhenoTM 還可以對(duì)植物質(zhì)量性狀進(jìn)行表型信息學(xué)分析。通過(guò)對(duì)擬南芥、甜瓜、橡膠的可見(jiàn)光頂部和側(cè)面成像,可以分析頂部和側(cè)面投影葉面積、緊湊度、圓度、生長(zhǎng)速率、卡尺長(zhǎng)度、株高、冠幅寬度、葉片顏色分布等形態(tài)參數(shù)。

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擬南芥對(duì)稱(chēng)性分析

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應(yīng)用高通量平臺(tái)分析水分對(duì)甜瓜的影響

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橡膠幼苗期表型分析





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